Il fut l’un des piliers de l’homéopathie américaine du XIXe siècle, à la fois médecin, chercheur, professeur et auteur d’une œuvre colossale. Il est surtout connu pour avoir dirigé et compilé l’Encyclopedia of Pure Materia Medica, une œuvre monumentale en douze volumes qui rassemble les pathogénésies des remèdes homéopathiques à partir d’expérimentations humaines et de sources primaires fiables.
Né en 1837 à Westminster (Vermont), Allen reçut une éducation médicale classique. Il obtint son diplôme à la New York University en 1861, avant de s’orienter vers la pratique homéopathique. Il mena une carrière académique prestigieuse, notamment à la New York Homeopathic Medical College, où il fut professeur de matière médicale et plus tard doyen. Son influence s’étendit à l’échelle nationale, tant sur le plan pédagogique que sur le plan éditorial.
L’œuvre de Timothy Allen se distingue par son esprit de rigueur scientifique. L’Encyclopédie qu’il coordonna entre 1874 et 1879 fut un projet ambitieux visant à ordonner systématiquement les symptômes obtenus par expérimentations sur des individus sains (provings) et à éliminer les données douteuses. Il ne s’agissait pas seulement d’une compilation : Allen y imposa une structure méthodique, rigoureuse dans les sources, fidèle aux observations originales et respectueuse du principe hahnemannien de l’expérimentation pure. L’encyclopédie devint la référence majeure de la matière médicale « pure », c’est-à-dire débarrassée des ajouts cliniques ultérieurs.
Parallèlement, Allen contribua à divers journaux médicaux, et s’intéressa aussi à la botanique et à la musique, domaines dans lesquels il montra un grand raffinement intellectuel. En tant que praticien, il était reconnu pour sa finesse clinique et son souci d’individualisation des traitements. Il fut également président de l’American Institute of Homeopathy, signe de son autorité dans le paysage homéopathique nord-américain.
Il est décédé en 1902 à New York, laissant une œuvre qui demeure l’une des plus précieuses pour les praticiens souhaitant revenir aux sources expérimentales de la matière médicale homéopathique.